Высшим руководящим органом ИКОМ является Генеральная Ассамблея, собирающаяся не реже одного раза в три года и состоящая из представителей всех Национальных и Международных комитетов, а также Региональных ассоциаций и Аффилированных организаций.

Генеральная Конференция ИКОМ проходит раз в три года, в то же время, когда собирается Генеральная Ассамблея и в том же месте. На Генеральной Конференции рассматривают и обсуждают практические и теоретические вопросы, связанные с музееведением и музеями, и, в частности, вопросы, касающиеся темы конференции, утвержденной предыдущей Генеральной Ассамблеей. Конференция получает и рассматривает также отчет о деятельности ИКОМ за предшествующий трехлетний период, а также его проект программы на последующие три года. Генеральная конференция может предложить резолюции, вытекающие из ее дискуссий.

Консультативный комитет ИКОМ является консультативным органом, который состоит из Президентов всех Национальных и Международных комитетов Региональных альянсов и Аффилированных организаций.

Исполнительный совет состоит из шестнадцати членов ИKOM, пятнадцать из которых избираются на три года членами с правом голоса. Председатель Консультативного комитета является членом Исполнительного совета по должности (ex officio). Членами Исполнительного совета являются Президент ИКОМ, два Вице-президента и казначей.

Президент ИКОМ созывает и ведёт заседания Генеральной Ассамблеи и Исполнительного совета. В период между сессиями Исполнительного совета он принимает все надлежащие меры и решения, которые ему кажутся необходимыми, в интересах ИКОМ. Генеральный директор ИКОМ назначается Исполнительным советом и работает по контракту.

Генеральный директор руководит всеми службами ИКОМ и несёт ответственность перед Исполнительным советом за компетентное и эффективное управление Организацией, а также за деятельностью Секретариата, Он осуществляет ежедневную деятельность под руководством Президента.

Выборы в Президиум ИКОМ, как и выборы Президента, проходят в рамках Генеральной конференции путем прямого тайного голосования. Основная функция — отслеживать выполнение основных положений Стратегического плана, исполнение решений Генеральной Ассамблеи и Консультативного комитета. В соответствии с Уставом ИКОМ Исполнительный совет возглавляет Президент ИКОМ. Заседания Исполнительного совета проходят 2-4 раза в год.

Консультативный совет (Advisory Council) состоит из Президентов национальных и международных профильных комитетов, а также Председателей аффилированных организаций и региональных альянсов. Заседания происходят раз в год в рамках Генеральной Ассамблеи в первых числах июня в Париже.

Основная задача комитета — консультирование Исполнительного совета и руководства ИКОМ по вопросам формирования политики, программ, процедурным вопросам и финансам. Комитет может предлагать правки в Устав ИКОМ.

Президент и Вице-президенты Консультативного комитета — выборные должности и выбираются путем прямого голосования членами комитета.

• Президент Консультативного комитета 2023-2025 гг. – Antonio Rodriguez (ICEE Board, Chair of SAREC, Venezuela and United States)
• Вице-президент Консультативного комитета 2023-2025 гг. – Medea S.Ekner (Сhair of ICOM Sweden)

Генеральная Ассамблея является высшим органом по формированию политики ИКОМ. В круг ее функций входит:

• принятие и, при необходимости, внесение поправок в Устав;
• принятие программы ИКОМ на последующие три года;
• принятие бюджета на следующий трехлетний период; принятие и одобрение отчета об исполнении программы ИКОМ в течение трех предыдущих лет;
• принятие и одобрение финансового отчета о предыдущем трехлетнем периоде;
• изучение вопросов, передаваемых на ее рассмотрение Консультативным комитетом, Исполнительным советом и Генеральной конференцией, и принятие по ним решений;
• принятие необходимых по ее мнению резолюций по вопросам, касающимся музеев, музейного дела и других областей интересов ИКОМ;
• составление необходимых по ее мнению директив по вопросам деятельности ИКОМ, направляемых Исполнительному совету;
• назначение даты и места проведения очередной Генеральной Ассамблеи и определение темы очередной Генеральной конференции; в случае необходимости, утверждение и внесение изменений в свой собственный регламент и регламент Генеральной конференции.

Решения Генеральной Ассамблеи являются неоспоримыми и не могут быть обжалованы.

Генеральная Ассамблея (и Генеральная конференция) собирается на обычное заседание раз в три года. Дата, место ее проведения и тема определяются предыдущей Генеральной Ассамблеей по рекомендации Консультативного комитета и Исполнительного совета. Назначая место проведения следующей Генеральной Ассамблеи и Генеральной конференции, Ассамблея изучает преимущества, предоставляемые различными регионами, и связанные с ее проведением расходы.

В Генеральной Ассамблее могут принимать участие любые действующие члены ИКОМ.

На сессиях Генеральной Ассамблеи и на выборах Исполнительного совета право участвовать в голосовании осуществляется следующим образом:

• каждый национальный комитет имеет право назначить пять лиц из числа индивидуальных членов или назначенных представителей коллективных членов ИКОМ данного комитета, включая любого члена Консультативного комитета или Исполнительного совета страны, где находится национальный комитет, для голосования от его имени по всем вопросам, переданным на рассмотрение Генеральной Ассамблее для принятия решения;
• каждый международный комитет имеет право назначить пять лиц из своих членов с правом голоса, являющихся индивидуальными или назначенными представителями коллективных членов ИКОМ, для голосования от его имени по всем вопросам, переданным на рассмотрение Генеральной Ассамблее для принятия решения;
• каждая присоединенная организация, более половины членов которой являются членами ИКОМ, имеет право назначить трех из своих членов, являющихся индивидуальными или назначенными представителями коллективных членов ИКОМ, для голосования от ее имени по всем вопросам, переданным Генеральной Ассамблее для принятия решения.